土壤诊断还应查看土壤表面，该方法是将患病植物的田地与正常植物的邻近土壤田地进行比较，以查看是否存在差异。如果是盐碱危害，则在一般植物病害区的地块表面会有更多的盐分累积或明显的盐分偏移，并可以初步确认诊断。但是，对于土壤养分，植物表现出缺乏某些养分或中毒的症状，肉眼无法判断，有症状区域的土壤表面与正常区域之间没有差异，需要借助土壤多参数测量仪进行检测。
土壤多参数测量仪诊断时，不仅是农作物的地上部分和土壤表面，还包括农作物的地下部分的症状和土壤状况，即从农作物和土壤中分析病因。从总体上讲，更正确地获得了土壤与农作物之间的生理协调关系，如土壤排水不良，通透性差，土壤中的有毒物质容易积聚在表层，一般农作物的根系又小又短。
在这种情况下，即使少量的新根是白色或棕色，而大多数根是黑色或烂根，整个农作物也会显得脆弱或枯萎。当土壤干燥时，根部吸收水分进入深层土壤，并且根部分布较深。当土壤表面潮湿时，土壤温度较低。但是，根系很短，并且大部分分布在表层。只有质地轻薄或深耕的土壤和根系才更均匀地分布。侧根很多，表皮光滑且无弯曲变形。由上可知，作物根系的生态变化是土壤某些特征的客观反应，是土壤诊断的重要方面。
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