随着化肥的添加，土壤结构遭到破坏，土壤环境受到污染，土壤营养逐渐失衡，问题越来越严重，尤其是对土壤氮、磷、钾三元素的影响更为突出。一般建议使用土壤多参数测量仪进行土壤微量元素检测，以获得土壤中各种养分的含量参数，为施肥提供科学有力的依据。
土壤微量元素检测结果表明，过量使用化肥破坏土壤结构，导致土壤板结，导致土壤有机质减少。化肥无法弥补有机质的不足，进一步影响土壤微生物的生存，不仅破坏了土壤肥力结构，还降低了肥效。
矿物原料和化肥用化学原料含有多种重金属元素、放射性物质等有害成分，随着施肥进入农田土壤形成污染。近年来，土壤污染日益严重，影响了农产品的营养价值、耐贮性和抗逆性，进而影响了人类健康。土壤多参数测量仪测定长期使用氮、磷、钾后的土壤营养，发现对土壤结构产生了破坏力，导致土壤营养失衡，营养流失，污染加剧。根据不同作物和土壤类型，平衡科学配方施肥，结合使用和营养，大力实施生产、供应、施用一体化的农化服务，从根本上改善土壤结构，培肥土壤，提高化肥和有机肥的吸收利用率，保持土壤肥力的长期利用。这不仅可以节约生产成本，提高作物产值，提高产品质量，还可以维护农业生态环境，进而提高农产品质量，增加农产品数量，实现高产、稳产。
